全图以“60”为主体，色彩明快，构图简洁，直接契合主题“60 周年庆”。其中左边的“6”，中间为宝蓝色的上海有机化学研究所的标识，十分醒目的传递出本标识的主题；红色的数字“6”规整又不失向外发展的动感，反映出有机所60 年来的严谨治学、持续发展和创新以及所庆之际的喜庆氛围；

右边的“0”，中间是抽象的宝蓝色地球，不仅在构图上协调了整个标识，更揭示了60年来，有机所在国际科学界的声誉斐然，国际上的科研活动十分频繁，也反映了有机所的科研工作对世界、环境和人类作出的重要贡献，同时也暗合有机所60 周年和上海“科技世博”举办时间的巧合相遇；整个数字“0”的外围可以看作抽象的苯环，是最能代表有机化学的经典结构，也和材料科学的代表形状“硅晶”、生物上的“蜂巢”结构等吻合，反映了有机人不仅在有机化学方面贡献卓著，也在诸多交叉科学领域里取得了令人瞩目的成绩；

此外实心的“6”和空心的“0”，代表了阴与阳、正和负，包含了化学作用中基本原理。