中国科学院天然产物有机合成化学重点实验室前身由著名的有机化学家黄鸣龙教授发起成立。五十年来,在天然产物合成化学领域取得了突出的成就。
实验室的研究成果曾获得国家自然科学二等奖3项、国家科技进步奖7项、国家创造发明奖3项、何梁何利基金科学与技术进步奖 2项,中科院重大成果奖6项、中科院自然科学奖3项、中科院科技进步奖10项、上海市科技进步奖9项等多种荣誉和奖励。
同时,实验室在新型药物创制、药物化学合成工艺、精细化学品以及有机新材料等战略性新兴产业的应用技术方面也具有很强的实力,在我国化学合成药物工业体系的形成、精细化学品和国防所需新材料的研制中起到重要作用;多年来,实验室为科研机构、相关企业培养的大批优秀的有机合成化学人才,已经成为我国合成化学领域的中坚力量。